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MBR具有水質好、占地省、產(chǎn)泥量低、自動控制好、穩(wěn)定性好等優(yōu)點，還有一些不足之處：
1、MBR膜主要分離污水中的大于膜孔徑的懸浮物，無法去除對于小于膜孔徑的懸浮物、溶解性污染物。污水回用時除了對懸濁度及懸浮物有要求，COD是最主要的指標應。廢水經(jīng)過二級生化處理后的污染物主要為一些難降解的溶解性污染物，對此類污染物MBR膜去除能力有限。
2、MBR 膜需要定期清洗
操作麻煩,并且MBR膜的使用壽命比較短，大部分使用1、2年就需要更換膜，使用長久的也就3年左右，這樣也增加了運行成本.
3、MBR膜也存在污泥膨脹的現(xiàn)象。污水處理工藝和污水水質對于是否發(fā)生污泥膨脹均有關系，而非污泥濃度高了就不會出現(xiàn)污染膨脹。例如，按照傳統(tǒng)理論“當工藝中同時存在厭氧、好氧環(huán)境時，就不會出現(xiàn)污染膨脹”，比如SBR工藝。但工程實際情況下并非如此，在處理某些種類廢水時，SBR也存在污泥膨脹。SBR的變形之一CAST工藝，前面所加的生物選擇區(qū)，其中之一的功能就是抑制絲狀菌大量增殖。對于普通的生活污水采用生物處理工藝，其氣水比范圍一般在1：3~7之間，具體數(shù)值與進水COD有關系。MBR之所以采用較高的氣水比，原因之一即為利用較高的空氣流速擦洗膜表面，以防止膜堵塞。這當然會使運行費用大幅上升。
